Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11bB4XVQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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