Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm6133B2RY53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6133B2RY53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms