Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms