Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3lB2RV38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms