Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms