Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud4B2RRE7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms