Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf518bB2RRE4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms