Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc2B2RR83 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms