Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf3B2RQG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms