Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms