Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1B2KF50 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms