Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn7aB1AYL1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms