Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mbd5B1AYB6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd5B1AYB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms