Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms