Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms