Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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