Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Skint4A7TZF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint4A7TZF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms