Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll11A4Q9F4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll11A4Q9F4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms