Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f28A2CFD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms