Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930402F06RikA2AUQ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms