Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin4A2AMM0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cavin4A2AMM0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cavin4A2AMM0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cavin4A2AMM0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms