Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SetxA2AKX3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms