Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FocadA2AKG8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FocadA2AKG8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms