Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc183A2AJB1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms