Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brwd3A2AHJ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brwd3A2AHJ4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms