Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ambra1A2AH22 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms