Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms