Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62clA2AG10 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62clA2AG10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms