Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms