Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms