Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp8nlA2ABX0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms