Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms