Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm16A2A935 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm16A2A935 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm16A2A935 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms