Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm2A2A7B5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm2A2A7B5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms