Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav12-2A0N8N6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms