Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms