Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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