Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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