Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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