Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms