Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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