Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms