Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28490A0A087WRT9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28490A0A087WRT9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms