Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Rabgef1Q9JM13 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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