Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms