Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms