Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pramef12Q9D2F1 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms