Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NubplQ9CWD8 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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