Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Trim12aQ99PQ1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim12aQ99PQ1 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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