Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms